校徽主体造型采用同心圆环图形，似充满动感的车轮，寓意着学校滚滚向前的发展态势，象征全校师生员工凝心聚力、追求卓越的坚定信念和团结、勤奋、求实、创新的优良校风。

两圆环之间上半部分为学校中文手书体名称 (费新我题写)，下半部分为英文校名“NANJI-NG AGRICULTURAL UNIVERSITY”，标识内心设计以大写的英文校名简称（NAU）变形组合成学校的标志性建筑“主楼”的造型图案，其下方为我校办学起始年份“1902”，其外部采用两株交叉联结的成熟麦穗向上环抱，象征学校的发展系建立在原中央大学农学院和金陵大学农学院两个重要前身及众多先辈们奋斗成果的基础之上，构图简洁，尊重历史，彰显了我校悠久的历史文化底蕴和以农科为优势的办学特色，寓意着我校人才培养、科学研究和服务社会等各项事业不断取得累累硕果。